DEBATNI KLUB
Tokom leta 2003. nekoliko gimnazijalaca učestvovalo je na debatnom kampu u Bačkom Petrovcu i odatle su doneli iskustva koja su preneli na ostale učenike. Od tada se u gimnaziji održavaju redovne debate sa temama iz đačkog i svakodnevnog života. Neke od obrađenih tema su: "Preljuba je opravdana", "Ženama je mesto u kuhinji", "Diskriminacija pri zapošljavanju je opravdana", "Muškarci su džentlmeni", "Profesori su nam profesori, a ne drugovi", "Muškarci se plaše uspešnih žena", "Žene više vole mačo tipove", itd.

NOVINARSKA SEKCIJA
Učenički časopis "Gimnazijalac" u gimnaziji postoji od 1969. godine. Od 2003. promenjen mu je naziv u "Virus" koji sada izlazi
u elektronskoj formi. Članovi novinarske sekcije posećuju novinske kuće, prave školske intervjue, sarađuju sa TVOK u izradi pojedinih televizijskih informativnih priloga, učestvuju u organizaciji Gymko kviza za osnovce i redovno prate sve važne pojedinosti iz svakodnevnog života škole.

GYMKO TEATAR
Početkom školske 2003/04. godine zaživela je i gimnazijska pozorišna sekcija. Prva predstava odigrana u okviru GymKo Teatra je "Sucking Dublin" po romanu irskog pisca Edna Walsha. Nakon toga gimnazijalci glume u pozorišnoj predstavi "Pepeljuga". Predstavama su mladi glumci osvojili nekoliko nagrada i dobili pohvale žirija.

MUZIČKA SEKCIJA
Od osnivanja gimnazije postojala je muzička sekcija u okviru koje je postojao hor, orkestar i folklor.
Ova sekcija je godinama predstavljala školu u Opštini, okrugu, pa čak i na međunarodnim omladinskim susretima. Godinama je sa više ili manje uspeha učestvovala na smotri hora i folklora "Tancuj, tancuj". Više puta su nastupali u saradnji sa kovačičkom Galerijom naivne umetnosti na otvaranjima izložbi naivnih slikara u Kovačici, Beogradu, Senti, Jagodini itd.

GYMKO KVIZ
Ove godine snimljen je 5. serijal edukativno-zabavnog programa „GymKo kviz za osnovce“ - Znanjem do kompjutera. Ovaj kviz zajednički treću godinu za redom organizuju gimnazija „Mihajlo Pupin“ i TVOK. Voditelji i članovi žirija su učenici gimnazije.

PSIHOLOŠKA SEKCIJA
Psihološka sekcija predstavlja novinu u vannastavnim aktivnostima škole. Njeni članovi bave se istraživnjima iz oblasti psihologije, učestvuju u raznim vidovima vršnjačkih edukacija, organizuju lokalne humanitarne akcije i upoznaju se sa poslovima psihologa na različitim radnim mestima.

SPORTSKE SEKCIJE

U gimnaziji postoje sportske sekcije, i to košarka, odbojka, fudbal, atletika i jadžent. Ova sekcija je godinama predstavljala školu na okružnim takmičenjima i imala zapažene rezultate.